کوکیهای پروتئینی انواعی از کوکیها هستند که با استفاده از مواد با پروتئین بالا، مانند پودر پروتئین، تهیه میشوند. این نوع کوکیها معمولاً برای تأمین پروتئین بیشتر در تغذیه و ورزشکاران، بدنسازان یا افرادی که به دنبال یک تنقلات سالم و پر انرژی هستند، مناسب هستند.