یکی از اصلی ترین ویژه هایی که مناطق آزاد را از سرزمین اصلی متمایز می کند بحث معافیت های مالیاتی در این مناطق است که در حال حاضر بحث مالیات بر ارزش افزوده به حذف کلی مالیات از این مناطق تسری پیدا کرده است.